Hlavnou úlohou oddelenia je zabezpečenie inštitucionálneho výskumu dejín maďarskej komunity na Slovensku. Oddelenie popri politicko-historickom výskume maďarskej komunity iniciuje a uskutočňuje aj výskum dejín spoločnosti, hospodárstva a životného štýlu. Okrem toho sa venuje historickému pozadiu maďarsko-slovenských vzťahov.
Hlavné oblasti výskumu
- politická, spoločenská a hospodárska situácia Maďarov v 1. Československej republike (1918-1938)
- situácia Maďarov v rokoch 2. svetovej vojny na Slovensku a v Maďarsku
- roky bez domoviny (1945–1948)
- Maďari v stalinistickom Československu a v období normalizácie
- úloha Maďarov žijúcich na Slovensku pri zmene režimu
Oddelenie kladie zvýšený dôraz na uskutočnenie doposiaľ chýbajúcich základných výskumov, pri ktorom okrem zhotovenia tematických monografií dostáva dôležitú úlohu aj vyhotovenie a publikácia pramenných dokumentov, bibliografií a chronológií.